בהחלטה תקדימית קבע ביהמ"ש שהמדינה הפלתה את הזרם הרפורמי בכך שתקצבה רק מוסדות אורתודוכסיים. "לכל זרמי הגיור תכלית זהה - שילובם התרבותי והרוחני של אזרחים ותושבים ישראלים בחברה ובקהילה בישראל"
בהחלטה תקדימית, בג"ץ הורה היום (שלישי) למדינה לתקצב מכוני גיור שאינם אורתודוכסיים. "לכל זרמי הגיור תכלית זהה - שילובם התרבותי והרוחני של אזרחים ותושבים ישראלים בחברה ובקהילה בישראל", כתבה נשיאת בית המשפט העליום, השופטת דורית ביניש בפסק הדין.
הרכב השופטות - ביניש, מרים נאור ועדנה ארבל - דן בעתירה שהגישה התנועה ליהדות מתקדמת בישראל, שמפעילה מוסדות פרטיים העוסקים בגיור רפורמי. בעתירה, שהוגשה באמצעות עו"ד עינת הורביץ, מנהלת המחלקה המשפטטית במרכז לפלורליזם יהודי של התנועה הרפורמית, נטען שמבחני תמיכה שגובשו על ידי המשרד לקליטת עליה מפלים אותה לרעה, מכיוון שהם מעניקים תמיכה כספית רק למוסדות פרטיים העוסקים בהכנה לגיור אורתודוכסי.
ועדה שהוקמה ב-1997 בראשות שר המשפטים הנוכחי, פרופ' יעקב נאמן, לבחון את נושא הגיור המליצה גם על הקמת מכון ללימודי יהדות, שיכין את המתגיירים לקראת הליכי הגיור בבתי הדין. זאת בעקבות גלי העלייה הגדולים ממדינות חבר העמים ואתיופיה בשנות ה-90, שבהם עלו לישראל גם מאות אלפי עולים שאינם יהודים. הוועדה המליצה שהמכון ייצג את שלושת הזרמים ביהדות - האורתודוכסי, הקונסרבטיבי והרפורמי.
לצד המכון הממשלתי הוקמו מכוני גיור פרטיים. המכונים האורתודוכסיים הפנו את המועמדים שלמדו אצלם לבתי הדין המיוחדים שהקימה המדינה, ואילו המכונים של הזרמים האחרים הפנו את התלמידים אצלם אל בתי הדין העצמאיים משלהם.
מאז 2005 זוכים המכונים האורתודוכסיים לתמיכה ממשלתית, בניגוד למכונים של הזרמים האחרים. עוד קודם לכן זכו המכונים האורתודוכסיים לתמיכה עקיפה מצד משרד החינוך. שמימן הורטה בכיתות הלימוד. תמיכה שנמנעה הזרמים האחרים.
התנועה הרפורמית טענה שגם היא זכאית לתמיכה. מנגד, במשרד הקליטה טענו שהגיור האורתודוכסי מוכר בכל המדינה בניגוד לשאר הזרמים, ולכן רק מוסדותיו זכאים לתמיכה. כמו כן, במשרד טענו שהתמיכה במוסדות הפרטיים מסתכמת בכ-1.5 מיליון שקל בשנה בלבד.
השופטות דחו את הטענה, והסבירו ש"חובתה של המדינה לעקרון הפלורליזם אינה מסתכמת בחובה פסיבית בלבד. יש למחויבות זו היבט אקטיווי, המטיל על על המדינה חובה להעניק תמיכה ליתר הזרמים". הן הורו לתמוך במוסדות הרפורמיים בהתאם לחלק היחסי של מכוניה במערך הגיור.
גלעד קריב, מנכ"ל התנועה הרפורמית, ברך על ההחלטה, אותה הגדיר "תקדימית וחשובה". לדבריו, "בג"ץ מאותת שיש יותר מדרך אחד להתגייר ושכל אזרח ישראלי יכול להחליט מה נתיב הכניסה שלו לעם היהודי". הוא הוסיף שהוא מקווה שהממשלה תכבד את פסיקת בג"ץ.