ב-2006 נרשמה עלייה של עשרות אחוזים במספר התקריות האנטישמיות ברוב מדינות אירופה - כך נמסר אתמול (ראשון) במסיבת העיתונאים השנתית של מטה המאבק באנטישמיות. מטה המאבק, המשותף לסוכנות היהודית, למשרד החוץ ולמשרד ראש הממשלה, הודיע כי בשנה שעברה חלה החמרה באופי האירועים האלימים נגד יהודים, והתגברו תופעות של השוואת ישראל לגרמניה הנאצית ושל הכחשת השואה.

מנתונים שסיפק המטה עולה, כי בצרפת נרשמו 360 אירועים אנטישמיים ב-2006, לעומת 300 אירועים ב-2005 ברוסיה כ-300 אירועים ב-2006 לעומת 250 ב-2005; באוסטריה 83 אירועים לעומת 50, ובמדינות סקנדינביה התרחשו 53 אירועים אנטישמיים ב-2006 לעומת 35 ב-2005. לפי הנתונים, נרשמה עלייה של כ-60 אחוזים במספר התקריות האנטישמיות באזור ברלין, ואולם לא נמסרו נתונים מספריים על מספר התקריות בגרמניה כולה. רק בבריטניה נרשמה ירידה: 312 אירועים בשנה שעברה, לעומת 321 ב-2005.

במטה המאבק הדגישו, כי הקשיים הרבים בהגדרת אירועים כבעלי רקע אנטישמי מגבילים את רמת הדיוק של המספרים, והם מעידים בעיקר על מגמות במצב האנטישמיות במדינות שנבדקו.

שרת החוץ ציפי לבני אמרה במסיבת העיתונאים, שעל מנהיגי מדינות להבין כי האנטישמיות היא בראש ובראשונה בעיה חברתית פנימית שלהם. יו"ר הסוכנות זאב ביילסקי אמר, כי "התופעות האנטישמיות באירופה חמורות מאוד, וגם מדינות כמו צרפת ואנגליה מתקשות להתמודד אתן". לדברי לבני, "אנחנו חייבים להעביר את המסר למנהיגים נוספים בעולם, שאם האנטישמיות מרימה את ראשה המכוער אצלם בבית - זו גם אשמתם".

שנת 2006 נפתחה בפרשת הרצח המזעזע של הנער היהודי-צרפתי אילן חלימי בינואר. ביילסקי סיפר במסיבת העיתונאים, כי אמו של חלימי החליטה לאחרונה להביא את גופת בנה לקבורה בישראל בתום שנה למותו. הלווייתו של חלימי תיערך ביום שישי הבא בירושלים.

מחזיק תיק האנטישמיות בסוכנות, עמוס חרמון, אמר כי "מלחמת לבנון, ובעיקר אירוע כפר קנא (הכפר הלבנוני שבו נהרגו 29 בני אדם בהפצצת חיל האוויר במהלך המלחמה) הביאו לאירועים קשים באופן שלא זכור מזה לפחות עשר שנים".

התקרית החמורה ביותר שאירעה על רקע המלחמה היתה התקפת ירי על משרדי הפדרציה היהודית בסיאטל, שבה נהרגה מזכירת הפדרציה פמלה ווכטר, ושלוש עובדות נוספות נפצעו קשה.

המלחמה בלבנון עוררה גל של ביקורות, שחלקן השוו את מעשי ישראל לאלו של גרמניה הנאצית. נשיא ונצואלה הוגו צ'אווס טען באוגוסט, כי התוקפנות הישראלית בלבנון "מזכירה את האופי הפשיסטי של היטלר". ראש עירייה בקנדה, סטפן גנדרון, אמר באוגוסט כי "הישראלים הם הנאצים המודרנים". כמו כן, בקריקטורה שהתפרסמה בעיתון נורווגי, נראה ראש הממשלה אהוד אולמרט כקצין אס-אס.

אירועים חמורים נוספים שהתרחשו ב-2006 היו דקירת מתפללים יהודים בבית כנסת של חב"ד במרכז מוסקווה בינואר, שבה נפצעו כעשרה בני אדם, והתקפת ירי בבית כנסת באוסלו בספטמבר, שהסתיימה ללא נפגעים. מבצעי האירוע היו מוסלמים שקיבלו סיוע מפעילי ימין קיצוני, ותיכננו גם לחטוף את שגרירת ישראל במדינה, מרים שומרת.

בשנה האחרונה התפרסמו מחקרים במדינות אירופיות שונות, שהצביעו על היקף תופעת האנטישמיות וחומרתה. דו"ח של ועדת חקירה מטעם הפרלמנט הבריטי קבע, כי גורמים איסלאמיים וחוגים בשמאל הקיצוני אחראיים להתגברות האנטישמיות במדינה. מחקר שהתפרסם בגרמניה הצביע על שימוש נרחב בביטויים אנטישמיים בבתי הספר, בעיקר על ידי תלמידים מוסלמים. מחקר שנערך באוקראינה העלה, כי לכשליש מבין אזרחי המדינה יש דעות שליליות על היהודים.