חרף מגמת השיפור, שפכי הנחלים בישראל סובלים מזיהום משמעותי
על פי דו"ח המשרד להגנת הסביבה, בנחלים פולג ואלכסנדר הזיהום עלה בשל זרימת ביוב ודשן חקלאי. בנוסף, הדו"ח ממליץ לאסור על דיג בכמה חופים ושפכי נחל ובכל המרינות והנמלים בשל הזיהום
הזיהום בנחלים בישראל נמצא במגמת ירידה, אולם רבים משפכי נחלי חוף מזוהמים בשל זרימת ביוב ודשן חקלאי - כך קובעים דו"חות הניטור הלאומי של מי החופים בישראל שהתפרסמו אתמול (רביעי), ועוסקים בזיהום, מגוון ביולוגי ושינויי אקלים. ממצאי הדו"חות מתייחסים לשנת 2016 וכוללים גם נתונים מהשנה שעברה.
על פי הדו"ח, על אף הירידה בזיהום, בנחלים אלכסנדר ופולג עלה הזיהום באופן משמעותי בשל פעילות חקלאית נרחבת באזור ובעיות בטיפול בשפכים. גם בשפכי נחלים נוספים בישראל נמצאו רמות זיהום בדרגה בינונית עד חמורה של חומרי דשן. ריכוזים גבוהים של זיהום עלולים לפגוע בבעלי החיים בנחל ולהביא לפריחת אצות רעילות באזור שפכי הנחלים. הדו"חות מציינים כי ריכוז חומרי הדשן המזהמים בנחלים בישראל גבוה בהשוואה לעולם בגלל הכמות הקטנה של המים הטבעיים בנחלים.